MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56E

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017488	TAT	2	6	107	112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829556
2	NC_017488	GAAA	2	8	138	145	75 %	0 %	25 %	0 %	385829556
3	NC_017488	AG	3	6	150	155	50 %	0 %	50 %	0 %	385829556
4	NC_017488	A	8	8	200	207	100 %	0 %	0 %	0 %	385829556
5	NC_017488	TAG	2	6	225	230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829556
6	NC_017488	A	6	6	259	264	100 %	0 %	0 %	0 %	385829556
7	NC_017488	TA	4	8	279	286	50 %	50 %	0 %	0 %	385829556
8	NC_017488	AT	3	6	443	448	50 %	50 %	0 %	0 %	385829556
9	NC_017488	A	6	6	454	459	100 %	0 %	0 %	0 %	385829556
10	NC_017488	TA	3	6	496	501	50 %	50 %	0 %	0 %	385829556
11	NC_017488	TGA	2	6	507	512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829556
12	NC_017488	A	6	6	518	523	100 %	0 %	0 %	0 %	385829556
13	NC_017488	GAA	2	6	531	536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829556
14	NC_017488	ATG	2	6	638	643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829556
15	NC_017488	CAA	2	6	659	664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829556
16	NC_017488	ACAA	2	8	765	772	75 %	0 %	0 %	25 %	385829556
17	NC_017488	A	7	7	806	812	100 %	0 %	0 %	0 %	385829557
18	NC_017488	ACA	2	6	873	878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829557
19	NC_017488	GAG	2	6	892	897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385829557
20	NC_017488	ATT	2	6	900	905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829557
21	NC_017488	AATA	2	8	907	914	75 %	25 %	0 %	0 %	385829557
22	NC_017488	A	7	7	1016	1022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017488	TATTT	2	10	1041	1050	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017488	TTA	2	6	1062	1067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017488	T	7	7	1072	1078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017488	T	7	7	1106	1112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017488	ACC	2	6	1123	1128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_017488	GTG	2	6	1139	1144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017488	A	6	6	1165	1170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017488	TCA	2	6	1183	1188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017488	ATTT	2	8	1238	1245	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017488	TGT	2	6	1250	1255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017488	ATTT	2	8	1256	1263	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017488	GTTTTG	2	12	1276	1287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017488	T	6	6	1288	1293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017488	T	6	6	1378	1383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017488	AGCGT	2	10	1487	1496	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017488	TGT	2	6	1513	1518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017488	TGAA	2	8	1544	1551	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017488	ATA	2	6	1552	1557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017488	AGCGC	2	10	1558	1567	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_017488	GGA	2	6	1583	1588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017488	TTGC	2	8	1642	1649	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017488	A	7	7	1684	1690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017488	AGCGC	2	10	1700	1709	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_017488	GGA	2	6	1725	1730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017488	TTGC	2	8	1784	1791	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017488	A	7	7	1826	1832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017488	A	7	7	1845	1851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017488	G	6	6	1853	1858	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017488	TAC	2	6	1882	1887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017488	C	6	6	1890	1895	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53	NC_017488	T	6	6	1964	1969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017488	T	6	6	2004	2009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017488	TTG	2	6	2035	2040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017488	ATT	2	6	2078	2083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017488	T	6	6	2093	2098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017488	A	7	7	2119	2125	100 %	0 %	0 %	0 %	385829558
59	NC_017488	A	6	6	2158	2163	100 %	0 %	0 %	0 %	385829558
60	NC_017488	GCG	2	6	2209	2214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385829558
61	NC_017488	AGA	2	6	2223	2228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829558
62	NC_017488	A	8	8	2252	2259	100 %	0 %	0 %	0 %	385829558

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.